도시형 테러 JS사건으로부터 4년이 지난 평화로운 미드칠더. 전기교도대의 에이스 오브 에이스 타카마치 나노하도 잠시 그 날개를 쉬게 하고, 새로운 세대가 자라난다. 나노하와 페이트의 딸인 비비오, 그리고 비비오와 같은 고대 베르카 왕족의 후손 아인하르트 스트라토스. 둘의 만남부터 성장에 대한 이야기가 지금 시작된다.